Man ändert doch keine bestehenden Versandarten oder Zahlungsarten sondern erstellt eine neue wenn man eine neue braucht. Die alte wird auf inaktiv geschalten und fertig.
Wenn man tatsächlich das macht was man machen möchte (neue Art und die alte nicht mehr), dann muss man innerhalb einer Software auch einfach nur genau das tun.
So vermeidet man übrigens i.d.R. bei jeder Software Fehler.
Was wenn du die Vorkasse gelöscht hättest aber weder Standard- noch Fallback-Zahlungsart in den Grundeinstellungen geändert hättest etc. etc.
Es sind eigentlich immer die gleichen unsauberen Aktionen die dann eben zu unsauberen Ergebnissen fürhen.