Ja. Wir haben unter 6.4 im Shop Einstellungen → SEO im Feld „Kategorieseite“ wohl Werte hinterlegt gehabt, die nicht kompatibel mit der Version 6.5 waren.
Die gelöscht, alles neu indiziert, Cache geleert und dann das Update auf 6.5 gemacht. Seitdem sind die Probleme verschwunden.