Falls es jemanden interessiert, 
der CLI Befehl muss so aussehen, wenn die Standardsprache Deutsch gesetzt sein soll (und die Standardwährung Euro):
bin/console system:install --create-database --shop-locale=de-DE --shop-currency=EUR --basic-setup
Mit --basic-setup wird gleich der Admin shopware User angelegt und ein Saleschannel, dies kann man auch anders machen, für mein Anwendungsbereich ist es sinnvoll.