Im Shopware Standard kannst du den Gutschein dann garnicht einlösen. Es muss immer der Mindestbestellwert größer/gleich dem Betrag sein. Das kannst du in SW also garnicht konfigurieren, dass der Gutschein größer dem Bestellwert sein kann.
Generell musst du das über das Riskmanagement regeln. Lege eine Zahlungsart kostenlos an und sag dann, wenn Betrag kleiner 0,01 dann kostenlos - alle anderen nur wenn Betrag größer 0,01.