Mach am Besten bei den Hauptkategorien Einkaufswelten draus. Dann aber nicht das Listing darunter anzeigen lassen, sondern einen Kategorieteaser im Zeilenmodul erstellen. Dann noch ein paar EKW Elemente wie Textboxen, Herstellerslider usw. darunter packen.
Durch eine Templateanpassung kannst du erwirken, dass der Kategorietext oben und das Banner auch bei der EKW angezeigt werden. Somit kommt die EKW erst darunter zum Vorschein.
Damit du den Text für Sidebar, Footer und Content Body Bereich über den Tiny Editor bequem einfügen kannst, empfehle ich dir das Plugin Seo Text von Six Media. Ohne Werbung machen zu wollen, aber dazu ist das Plugin top!
Der Text unterhalb des Listings im Body ist zwar der wichtigste, aber auch im Footerbereich und in der linken Sidebar solltest du ein paar kleine Texte mit Bildern zum Thema unterbringen.
Dann solltest du auch den Quellcode minimieren. Ist der Quellcode zu lang, also mehr als 10000 Codezeilen, könnte der Crawler abbrechen, weils zu lang ist.
Dazu nutze ich in 2 Shops das Plugin von Vio. Einfach im Store suchen.
In der untersten Kategorie Ebene werden es dann vermutlich nicht mehr so viele Kategorien sein vermute ich. Da solltest du dann keine EKW mehr machen.
Zumindest berichte ich hier von meinen eigenen Seo Erfahrungen, die ich in den letzten 12 Jahren sammeln konnte.
Damals hatte ich eine andere Shopsoftware. Da konnte man schon alles im Standard so machen. Bei Shopware muss man da schon einiges mehr “umbauen” und Plugins nutzen. Dann gehts auch.
Am Besten testest du deine Sites mit seorch.de Dort kann man mit der PRO Analyse auch die EKWs auslesen lassen, obwohl sie ja aus dem Ajax nachgeladen werden. Dank Sonic hier aus dem Forum konnte ich durch dessen Templateanpassung erwirken, dass der Text in der EKW auch im Quellcode steht.
Wirf also den Anker aus und freu dich darüber. 
Viele Grüße
Matthias