Sonst frag doch zunächst mal bei Deinem Hoster nach, ob dieser ein Backup von vor Deinem Upgrade Deines Webspace einspielen kann.
Den Media Ordner kannst Du natürlich vorher umbenennen oder sichern - der reine Media Ordner bringt Dir aber nicht viel (allenfalls hast Du halt noch all die Bilder) - es fehlen die Referenzierungen bei einer Neuinstallation und Artikel/Kategorien usw. sind dann ohnehin alle weg, da diese Informationen in der Datenbank gespeichert sind.