Ich hatte den Fehler ebenfalls und konnte ihn wie folgt lösen.
Einfach folgende Datenbanken vor dem Update löschen:
DROP TABLE `s_filter_options_attributes`, `s_filter_values_attributes`, `s_product_streams_attributes`, `s_attribute_configuration`;
DROP TABLE `s_user_addresses_attributes`, `s_user_addresses`, `s_user_addresses_migration`;
Danach lief das Update fehlerfrei durch.