Ich vermute du hast deine Themes falsch angelegt. Bei Verwendung von Subshops muss man sich vorher im klaren sein, wie am Ende das Layout und das Design aussehen soll. Und was bei Anpassungen zu beachten.
Variante 1 - wenn Layout und Design gleich sein soll:
Zunächst wird ein Theme zum Hauptshop angelegt, welches von „Responsive“ ableitet.
Das Theme vom Subshop wird dann als Ableitung vom Hauptshop angelegt. Änderungen werden hier in der Regel im Hauptshop vorgenommen. Nur Anpassungen im Subshop werden auch im Theme vom Subshop vorgenommen.
Varinate 2 - wenn sich Layout und Design unterscheiden:
Für Haupt- und Subshop werden getrennte Theme angelegt, welche von „Responsive“ ableiten. Anpassungen und Änderungen wirken sich nur im jeweiligen Shop aus.
Kurz um, in deinem Falle müsstest du die Variante 1 wählen und Anpassungen die im Haupt- und Subshop greifen sollen, im Theme vom Hauptshop machen.