Ich kenne Strato nicht, aber die Einstellung in der php.ini sieht komisch aus:
zend_extension = /home/strato/www/cl/www.clickandtools.de/htdocs/ioncube_loader_sun_5.6.so
Normalerweise sieht es so aus:
zend_extension=ioncube_loader_lin_5.6.so
In der Systeminfo (SW Backend) müsste das aber auch angezeigt werden, wenn es richtig eingebunden ist.
Ob du das ganze brauchst weiß ich nicht. Vielleicht hast du noch alte Plugins die verschlüsselt sind. Dies könnte man mit einem Plugin überprüfen: