Migration von 5 zu 6 - Root Kategorie fehlt

Shopware 6 (German)
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Hallo,

ich versuche die BasicSettings eines Sw5 Shops zu einem neuen Sw6 Shop zu migrieren.
Scheinbar holt er sich dabei aber wohl nicht die Root-Kategorie (ID: 1) und wirft mir daher tausende Fehler aus.

[error] SWAG_MIGRATION_RUN_EXCEPTION
An exception occurred
Entity: category, sourceId: 200
Parent entity for "category: 200" child not found.

Hat das Problem schon einmal jemand gehabt?
Dadurch dass er die Root-Kategorie nicht hat, legt er natürlich auch keine Kategorien an und läuft somit auch bei den SalesChannel ins Leere.

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Ich konnte es lösen indem ich im Connector Plugin in Sw5 in der Datei src/custom/plugins/SwagMigrationConnector/Repository/CategoryRepository.php die Zeile 84 ($query->andWhere(‚category.parent IS NOT NULL‘);) auskommentiert habe.
Nur warum ist das da drin? Er holt somit keine Kategorie wo parent = NULL ist. Also die Hauptkategorie. Aber eben ohne diese legt er die anderen nicht an.
Hab ich hier einen Denkfehler? Wäre das ein Bug, hätten sicher mehrere das Problem.