Hallo,
wir haben soeben versucht das aktuelle SW6 Release auf unseren Servern zu entpacken. Weder TAR noch GZIP sind in der Lage das Archiv zu entpacken. Ist es jetzt wirklich so, dass man die entpackten files hochladen muss ?
Sehe gerade den Wald vor lauter Bäumen nicht 
eigentlich geht das ganz normal. Aber vielleicht liegt hier das Problem: Shopware 6 - Erste Schritte - Installation
Nachtrag: ist das nicht ein ZIP?
Kommt darauf an, wie du dir dein Shopware holst und mit welchem OS du arbeitest, mit git solltest du dir keine Gedanken über packen und auspacken machen müssen.
Ähnliches über docker.
Wenn du dir das übers web ziehst, mit wget https://www.shopware.com/de/Download/redirect/version/sw6/file/install_v6.4.8.0_2a7a580c3e9237f8476d6d8c3636d05eef3ee7e3.zip
Bekommst du ein Zip-File, auspacken per konsole in Linux mit:
unzip install_v6.4.8.0_2a7a580c3e9237f8476d6d8c3636d05eef3ee7e3.zip