Zu den Passwörtern: In dem Magento Migration Plugin scheint es dafür zumindest schon einen LegacyEncoder zu geben.
Hattest du das schon probiert (ich noch nicht). Hätte es jetzt so vermutet:
$importCustomer['legacyEncoder'] = 'Magento19';
$importCustomer['legacyPassword'] = 'deinMagentoHash';