Problem gelöst. Für alle, die irgendwann mal das gleiche Problem haben (und sich dabei in den Steuer-, Versand- oder Zahlungsart-Einstellungen tot suchen): Unter Einstellungen > Länder gibt es unabhängig von dem gesamten Steuereinstellungen noch 2 Haken, ob der Verkauf für B2C oder B2B Kunden steuerfrei sein soll. Diese waren in dem Fall für das entsprechende Land beide gesetzt.
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