Das ist früher (Shopware 5.2 und älter) immer im Zusammenspiel mit Plugins passiert. Bei dir wird also sicherlich auch ein Plugin der Auslöser sein. Wenn du es nachstellen kannst, deaktiviere doch mal alle Plugins und teste dann nochmal. Du kanst dir ja eine Testkopie des Shops anlegen.
Unabhängig davon hast du auch die Möglichkeit das unique zu setzen und dann zu schauen, was genau nicht mehr funktioniert.