Ich hatte das analoge Problem bei der Installation des neuen Stripe-Plugins. Dein Beitrag hat mich auf die richtige Spur gebracht. Auch bei mir waren die beiden Konsolenausgaben unterschiedlich. Ich habe dann in der Datenbank gesucht.
In der system_config gab es zwei Einträge für core.app.shopID, jeweils mit http und https. Ich weiß nicht, ob das so sein soll oder ob das ein Fehler ist, aber nach dem Sichern der Datenbank und der Tabelle habe ich einfach den http-Eintrag gelöscht.
Bisher kann ich keinen Fehler feststellen, dafür ließ sich das Plugin jetzt fehlerfrei installieren.
Bei Bedarf kann ich den Eintrag jetzt wieder einfügen.