Grundsätzlich war wohl dein Backup fehlerhaft, da die Tabellen usw. alle noch da sind. Die gib es ja in einer 5.5 noch garnicht. Wahrscheinlich wirst du dich jetzt durch 20-30 Fehler manuell durcharbeiten müssen, um das wieder gerade zu biegen.
Laut Fehlermeldung ist einer der vielen Foreign-Keys schon vorhanden: shopware/1616-add-mail-log-table.php at 5.6 · shopware/shopware · GitHub