Du musst in den Shopeinstellungen > Shops den Unterordner rauslöschen, wenn du die Domain umroutest. Sonst sucht Shopware unter meinedomain.de/unterordner/.../*.css die css-files und die liegen ja nach dem umrouten unter meinedomain.de/.../*.css. Dann wird halt das Theme ohne Javascript und Styles angezeigt. Das muss man im Backend korrigieren und dann den Cache löschen, dann gibt es den Anzeigefehler nicht.