Am besten spielst du erstmal dein Backup ein (Datenbank und Filebasis). Danach solltest du deine Datenbank erstmal bereinigen, denn die war vor dem Update schon nicht sauber. Hier gibt es ein Beispiel dafür: https://forum.shopware.com/discussion/comment/170022/#Comment_170022
Danach nochmal Update starten.