in der Tat habe ich gerade ein ähnliches Problem. Bei mir kommt ElasticSearch 6.4.2 mit Shopware 5.5.1 zum Einsatz.
das ein oder andere konnte ich schon lösen. Bei mir war unter anderem das Problem, dass der ESCluster wärend der replikation auf den Status yellow wechselt.
In der Shopware config gibt es hier auch einen Eintrag siehe shopware/Default.php at 5.5 · shopware/shopware · GitHub
Ich glaube nun bin ich an deinem Problem angelangt. Es hat leider vorn und hinten nicht funktioniert. Das einzigste was funktioniert hat war der Downgrade von ElasticSearch 6.4.2 auf ElasticSearch 5.6.12 nun funktioniert alles einwandfrei.