Ist zwar schon etwas her, aber die langsame Query aus dem Anfangspost kommt von der neuen Preisfilter-Berechnung seit Shopware 5.3 - dort wird bei jedem Aufruf der günstigste Preis über alle Varianten der Kategorie ermittelt. Hat man viele Varianten, dann sollte man diesen unbedingt deaktivieren. Die Query legt gern den ganzen Shop lahm wenn viel Traffic drauf kommt.
Einstellungen > Grundeinstellungen > Filter / Sortierung > Preis
Beim Cache prüfen ob ggf. URL-Parameter ausgeschlossen werden können. Diese erzeugen bei gleicher HTML-Ausgabe sonst doppelte und dreifache Cache-Dateien mit identischem Inhalt. Gute Kandidaten sind Anhängsel von irgendwelchen Preissuchmaschinen.