Hallo,
es gibt die Möglichkeit jeder Datei eines Plugins einen Hashwert zuzuordnen (wie das im sicherheitsrelevanten Bereich auch bei OpenSource häufig gemacht wird, um die Integrität von Dateien kontrollieren zu können). Der ist beim Support in wenigen Sekunden abgeglichen. Wenn der Hash nicht mit dem hinterlegten übereinstimmt, wurde die Datei vom Kunden verändert und der Support ist kostenpflichtig, was auch so in den AGB festzulegen wäre.
Das ist einfach und für jeden Kunden nachvollziehbar.