Warum das mit den Shopseiten so durcheinander ist weiß ich jetzt, kann es aber nicht ändern. In den Grundeinstellungen/Subshop steht unter meinem angelegten Subshop: Texte vom Supshop erben: und dort ist der Hauptshop eingetragen. Dort ist ein Auswahlfeld, aber ich kann nichts auswählen oder verändern. Da ich eigene Texte für den Sub angelegt habe müsste ich auch dort diese auswählen können, geht aber nicht. Liegt auch nicht am Browser. Habe es in verschiedenen versucht, aber Auswahlfeld ist keins! Deshalb das Durcheinander zwischen beiden Shops. 
Und das Problem das die Domain nicht für jeden Shop angezeigt wird besteht weiterhin.