Hi,
ich kann das bestätigen. Wir haben 5.6.1 auf Staging installiert. Da geht es noch, wie es soll. Ab 5.6.2 wählt er die Parent-Kategorie zum Subshop aus (z.B. Subshop startet bei Kategorie mit der ID 3, das Parent wäre Kategorie mit der ID 2, dann startet er bei 2) und erstellt von da aus die Sitemap. In unserem Fall versucht er dann Kategorien eines anderen Shops mit einzubinden, was mit der Root-URL vom eigentlichen Shop natürlich 404s produziert.
LG,
Max