Wann hast du auf 5.5.4 aktualisiert und ist die Datenbank auch sicher auf dem Stand von 5.5.4? Schau bitte mal ob in der s_core_countries die Spalte “allow_shipping” tatsächlich vorhanden ist. Wenn nicht, könnte es vielleicht eine Versionsdifferenz zwischen Codebase und Datenbankschema geben. Das Feld gibt es meines Wissens erst seit 5.5.3.
Nachtrag: Bitte führe - um andere Ursachen vielleicht ausschließen zu können - auch noch sw:cache:clear und sw:generate:attributes auf der Konsole aus!