Hallo,
du musst überhaupt nicht an der Datenbank arbeiten. Es gibt Updates dafür, so wie andere User es auch machen. Dann muss man sich auch nicht mit der Struktur auskennen.
Es gibt Tabelle, die parallel im System befüllt werden, z.B. Statistiken. Sowas wird einfach beim Import Export gar nicht berücksichtigt. Daher am besten immer das Updatescript nutzen! Dabei werden ja immer nur Änderungen/Updates durchgeführt und die Daten nicht weiter angefasst. Beim Import werden alle Daten angefasst. Fehlerpotential ist da also viel höher und nur Daten importiert, die speziell zuvor exportiert werden konnten.
Generell zum Thema siehe hier: https://forum.shopware.com/discussion/comment/185686/#Comment_185686