Es gehen nur die Daten verloren die während der arbeiten an der kopierten Instanz gemacht werden.
Entweder also danach ein Abgleich der Daten machen wenn aus Test wieder zu produktiv repliziert wird, oder diese Daten einfach auslassen sodass Bestellungen+Kunden nie überschrieben werden in der Produktivdatenbank.
Updates z.B. macht man ja i.d.R. Spät Abends wenn das Tagesgeschäft durch ist, dann passiert ja meist eh nichts. Ansonsten, Wartungsmodus aktivieren damit in der Zeit keine Order dazwischenfunken kann.